M.Ö. 2. yüzyıl, Roma İmparatorluğu eski Yunanistan'ı fethetti. Dünyaca tanınmış eski Olimpiyat Oyunları da çökmeye başladı. M.S. 4. yüzyılın sonuna kadar, eski Yunanistan'ın yöneticisi Roma İmparatoru Ibirici Theodosius, Hristiyan'ı ulusal din olarak ilan etti. Roma İmparatorluğu'nda Jesus'a inanılmaya başlandı. Bu arada Tanrı Zeus'u anmayı amaçlayan eski Olimpiyat Oyunları kafir etkinlik olarak görüldü. Roma İmparatorluğu'nun Yunanistan'a yönelik yönetimi korumak ve Hristiyan'ın İmparatorluk'taki statüsünü sağlamlaştırmak için, M.S. 394 yılında Birinci Theodosius'un emriyle eski Olimpiyat Oyunları durduruldu. Böylece 1169 yıl içinde 263 dönem düzenlenmiş eski Olimpiyat Oyunları tamamıyla yok edilmiş.
M.S. 395 yılında, Olimpiyat kenti savaş nedeniyle büyük zarar gördü. M.S. 426 yılında, İkinci Theodosius, Hristiyan adına Olimpiyat kentindeki bütün yapıları ateşe verdi. Bugün gördüğümüz Zeus Tapınağı, zamanın dünyanın 7 harikasından biriydi. Ateşten sonra yalnızca davarları kaldı. Ondan yüz yıl sonra, büyük sel ve şiddetli deprem etkisiyle Olimpiyat kentinin kalıntısı yer altına gömüldü. Eski Olimpiyat Oyunları'nın kalıntısı tamamıyla yok edildi. Zamanla, Olimpiyat kentinin kalıntısının bulunduğu yer, sıradan bir taş ocağına dönüştürüldü. Eski Olimpiyat Oyunları gittikçe insanlar tarafından unutuldu. Yunanlıların çoğunluğu Olimpiyat kentinin kalıntısının bulunduğu yerde bir zamanlar görkemli Olimpiyat Oyunları'nın düzenlendiğini bile bilmedi.
Eski Olimpiyat Oyunları'nın yok olmasına rağmen, Olimpiyat Oyunları'nın ruhu ile uyumluk ve bütünleşme düşüncesi yok edilmedi. Avrupa'nın "orta çağ karanlığı"na girdiğinde, eski Olimpiyat Oyunları'nın medeniyet ışığı, zamanın karanlık yönetimine karşı çıkan düşünürler tarafından yakıldı.