Federer, 2004 yılının başında Melbourne'deki Avustralya Açık Tenis Turnuvası'nda 7 güçlü rakibini yenerek Avustralya topraklarındaki ilk şampiyonluğunu kazandı. Federer, 4 Temmuz 2004'te Wimbledon Açık Tenis Turnuvası finalinde ilk seti kaybetmesine karşın ardı ardına 3 seti kazanarak Andy Roddick'i yenip bir kez daha şampiyon oldu. Wimbledon'daki başarısı ile Federer bütün rakiplerini geride bırakarak yıl sonunda dünya sıralamasında 1. sıraya yerleşmeyi garantiledi.

    Federer'in 2004 yılındaki başarıları bunlarla sınırlı değil. 12 Eylül akşamı, Federer için mükemmel bir akşamdı. 2002 yılına kadar yenilmez bir raket olarak kabul edilen Lleyton Hewitt'in karşısına çıkan Federer, 2004'ün kesinlikle "Federer yılı" olduğunu kanıtladı. Federer, finalde Hewitt'e set vermeden karşılaşmayı 3-0 kazandı ve Mats Wilander'den sonra bir yıl içinde 3 kez grand slamda şampiyon olma başarısına ulaştı.

    Federer, 3 Ekim'de sona eren Tayland Açık Tenis Turnuvası'nda "Servis Motoru" olarak adlandırılan Andy Roddick'i yenerek, yıl içindeki 10. şampiyonluk kupasını kaldırdı, böylece 2004 sezonuna mükemmel bir nokta koydu.